Надо ли встать перед знаком Стоп, отстояв только что перед ж/д переездом?

Да. Знак бескомпромиссно предписывает остановку транспортного средства. И более того, он просто так не ставится. Чаще всего ставится на тех местах, где водитель должен проявить особое внимание, которое трудно проявить во время управления транспортным средством, а по сему, от водителя требуют остановки. Человеческий мозг так устроен, что он более внимательно относится к движущимся объектам, если сам не движется. Это пережиток каменного века, когда люди от животных еще не так далеко ушли. Но основные инстинкты и в наши дни еще никуда не делись. Именно их и призван активировать этот знак.А потому, если его кто то поставил, значит основания были. Или это особо опасное место с какими то пересечениями, или с железной дорогой. Но так или иначе - соблюдайте правила, в том числе и в плане выполнения требований знаков, какими бы они странными не казались. В конечном итоге, если дойдет до разбора дорожного происшествия, Вас будет сложнее в чем то упрекнуть. Вы все выполнили. Тем более, что все это вовсе не так сложно.

Да знак точно без всяких прошел поезд, дорога однопутка, что ждать предписывает остановку. В данном случае остановка обязательна не для того чтоб посмотреть нет ли приближающего поезда, а для того чтоб водитель перешел на низшую передачу. Потому как переключатся на путях чревато тем что что то может пойти не так. Заглохнет двигатель, включите не ту передачу.

Не знаю есть сейчас такие переезды где просто рельсы и шпалы. У нас все практически выравнены и рельсы не выступают. Но знаю точно такие были. Так на таком переезде если остановится для переключения передачи вообще можно забуксовать. Вот для этого остановка обязательна.